Dans l'organisme, calcium et magnésium forment un duo équilibré qui "travaille" ensemble. Le magnésium est un bloqueur de canaux calciques au niveau des cellules. Un déficit en magnésium provoque un excès de calcium qui va pénétrer dans les cellules et entraîner des crampes musculaires, de la fibromyalgie, une vasoconstriction, des maux de tête, de l'anxiété.
Le magnésium contribue à la fixation du calcium par les os. Un manque de magnésium pourra donc engendrer une séparation du calcium par rapport à l'os provoquant des calcifications, notamment chez les personnes âgées. Ce calcium peut aussi migrer dans les artères (on parle alors d'athérosclérose calcifiante) ou au niveau rénal en provoquant des calculs rénaux.
Si la carence en magnésium est importante, on parle d'hypomagnésémie, qui peut alors provoquer des nausées, crampes, vomissements, perte d'appétit, spasmes musculaires et tremblements.
Dans les cas les plus graves, l'hypomagnésémie (carence en magnésium) peut provoquer chez les enfants des convulsions.